MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 2383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	TTG	2	6	17	22	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016838	AAT	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016838	CGC	2	6	158	163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016838	CGGTA	2	10	232	241	20 %	20 %	40 %	20 %	378975691
5	NC_016838	TGC	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975691
6	NC_016838	A	6	6	329	334	100 %	0 %	0 %	0 %	378975691
7	NC_016838	A	6	6	336	341	100 %	0 %	0 %	0 %	378975691
8	NC_016838	CAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975691
9	NC_016838	GAA	2	6	497	502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975691
10	NC_016838	CAA	2	6	512	517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975691
11	NC_016838	CG	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	378975691
12	NC_016838	GTT	2	6	645	650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975691
13	NC_016838	CT	3	6	653	658	0 %	50 %	0 %	50 %	378975691
14	NC_016838	ACG	2	6	795	800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975691
15	NC_016838	GAAGA	2	10	822	831	60 %	0 %	40 %	0 %	378975691
16	NC_016838	CGA	2	6	836	841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975691
17	NC_016838	CAA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975691
18	NC_016838	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975691
19	NC_016838	CTG	2	6	969	974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975691
20	NC_016838	TCA	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975691
21	NC_016838	TCC	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975691
22	NC_016838	GC	3	6	1082	1087	0 %	0 %	50 %	50 %	378975691
23	NC_016838	GCAG	2	8	1283	1290	25 %	0 %	50 %	25 %	378975691
24	NC_016838	AAG	2	6	1291	1296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975691
25	NC_016838	TGC	2	6	1643	1648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016838	TGG	2	6	1961	1966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975692
27	NC_016838	ATG	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975692
28	NC_016838	TCTCAA	2	12	2049	2060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975692
29	NC_016838	AACC	2	8	2084	2091	50 %	0 %	0 %	50 %	378975693
30	NC_016838	CGT	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975693
31	NC_016838	TGT	2	6	2156	2161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975693
32	NC_016838	CGCCAA	2	12	2177	2188	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975693
33	NC_016838	GA	3	6	2224	2229	50 %	0 %	50 %	0 %	378975693
34	NC_016838	CGC	2	6	2237	2242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975693
35	NC_016838	GAC	2	6	2244	2249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975693
36	NC_016838	GC	3	6	2279	2284	0 %	0 %	50 %	50 %	378975693
37	NC_016838	TAG	2	6	2297	2302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975693
38	NC_016838	CTG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975693
39	NC_016838	CAG	2	6	2370	2375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975693
40	NC_016838	AG	3	6	2374	2379	50 %	0 %	50 %	0 %	378975693
41	NC_016838	CAG	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975693
42	NC_016838	GAC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975693
43	NC_016838	ATC	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975693
44	NC_016838	ATA	2	6	2592	2597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975693
45	NC_016838	TACT	2	8	2777	2784	25 %	50 %	0 %	25 %	378975694
46	NC_016838	TAT	2	6	2785	2790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975694
47	NC_016838	TTC	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016838	CCA	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_016838	GTT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016838	ATA	2	6	3085	3090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016838	CTT	2	6	3132	3137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975695
52	NC_016838	TCG	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975695
53	NC_016838	CGA	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975695
54	NC_016838	CTT	2	6	3253	3258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975695
55	NC_016838	CTT	2	6	3303	3308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975695
56	NC_016838	CGGGT	2	10	3350	3359	0 %	20 %	60 %	20 %	378975695
57	NC_016838	ATCTT	2	10	3440	3449	20 %	60 %	0 %	20 %	378975695
58	NC_016838	CAC	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975695
59	NC_016838	GGT	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975695
60	NC_016838	AAT	2	6	3580	3585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975695
61	NC_016838	GC	3	6	3601	3606	0 %	0 %	50 %	50 %	378975695
62	NC_016838	TTC	2	6	3844	3849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975695
63	NC_016838	GCT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975695
64	NC_016838	TCATCC	2	12	3884	3895	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975695
65	NC_016838	CCT	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975695
66	NC_016838	GGC	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975695
67	NC_016838	GGC	2	6	4025	4030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975695
68	NC_016838	CCG	2	6	4064	4069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975695
69	NC_016838	AATC	2	8	4113	4120	50 %	25 %	0 %	25 %	378975695
70	NC_016838	TGC	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975696
71	NC_016838	T	6	6	4164	4169	0 %	100 %	0 %	0 %	378975696
72	NC_016838	GCG	2	6	4242	4247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975696
73	NC_016838	TCA	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975696
74	NC_016838	CGT	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975696
75	NC_016838	GA	3	6	4294	4299	50 %	0 %	50 %	0 %	378975696
76	NC_016838	GAC	2	6	4307	4312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975696
77	NC_016838	GCCG	2	8	4355	4362	0 %	0 %	50 %	50 %	378975696
78	NC_016838	CAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975696
79	NC_016838	GAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975696
80	NC_016838	TGA	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975696
81	NC_016838	CAG	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975697
82	NC_016838	TGGG	2	8	4602	4609	0 %	25 %	75 %	0 %	378975697
83	NC_016838	TCA	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975697
84	NC_016838	TCT	2	6	4677	4682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975697
85	NC_016838	TTG	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975697
86	NC_016838	TGA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975697
87	NC_016838	CGT	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975697
88	NC_016838	GCG	2	6	4775	4780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975697
89	NC_016838	GCA	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975697
90	NC_016838	GCC	2	6	4813	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975697
91	NC_016838	TGT	2	6	4845	4850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975697
92	NC_016838	GAG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975697
93	NC_016838	AGGC	2	8	4900	4907	25 %	0 %	50 %	25 %	378975697
94	NC_016838	GTCGCC	2	12	5005	5016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975697
95	NC_016838	GTTG	2	8	5042	5049	0 %	50 %	50 %	0 %	378975697
96	NC_016838	GAC	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975697
97	NC_016838	CAT	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975697
98	NC_016838	CTT	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975697
99	NC_016838	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975697
100	NC_016838	CGA	2	6	5300	5305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975697
101	NC_016838	TGG	2	6	5372	5377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975697
102	NC_016838	CAG	2	6	5500	5505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975698
103	NC_016838	GGC	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975698
104	NC_016838	AGC	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975698
105	NC_016838	CTT	2	6	5583	5588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975698
106	NC_016838	CAG	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975698
107	NC_016838	TGC	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975698
108	NC_016838	GCA	2	6	5744	5749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975698
109	NC_016838	AGC	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975698
110	NC_016838	GGT	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975698
111	NC_016838	GGC	2	6	5776	5781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975698
112	NC_016838	TGC	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975698
113	NC_016838	CAG	2	6	5827	5832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975698
114	NC_016838	TCA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975698
115	NC_016838	CGT	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975698
116	NC_016838	CTT	3	9	5988	5996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975698
117	NC_016838	ATC	2	6	6016	6021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975698
118	NC_016838	TCG	2	6	6053	6058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975698
119	NC_016838	GC	3	6	6155	6160	0 %	0 %	50 %	50 %	378975698
120	NC_016838	TTG	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975698
121	NC_016838	AGCG	2	8	6201	6208	25 %	0 %	50 %	25 %	378975698
122	NC_016838	CA	3	6	6228	6233	50 %	0 %	0 %	50 %	378975698
123	NC_016838	GCAC	2	8	6238	6245	25 %	0 %	25 %	50 %	378975698
124	NC_016838	CTT	2	6	6285	6290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975698
125	NC_016838	CTC	2	6	6295	6300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975698
126	NC_016838	GAA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975698
127	NC_016838	TCC	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975698
128	NC_016838	TTG	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975698
129	NC_016838	TTA	2	6	6386	6391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975698
130	NC_016838	GTT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975698
131	NC_016838	CGC	2	6	6444	6449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975698
132	NC_016838	TTG	2	6	6497	6502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016838	ATA	3	9	6567	6575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016838	TACT	3	12	6582	6593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016838	GGGT	2	8	6611	6618	0 %	25 %	75 %	0 %	378975699
136	NC_016838	GA	3	6	6695	6700	50 %	0 %	50 %	0 %	378975699
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142	NC_016838	CAAA	2	8	7160	7167	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016838	A	6	6	7165	7170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016838	CCG	2	6	7172	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_016838	TCG	2	6	7302	7307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975700
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150	NC_016838	T	7	7	7504	7510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016838	CTG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016838	TCGAC	2	10	7601	7610	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_016838	ATG	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016838	ATC	2	6	7637	7642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975701
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159	NC_016838	ATT	2	6	7788	7793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975701
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171	NC_016838	TCCT	2	8	8624	8631	0 %	50 %	0 %	50 %	378975703
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239	NC_016838	TGG	2	6	12180	12185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_016838	TTC	2	6	12806	12811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975705
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258	NC_016838	TTG	2	6	13518	13523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_016838	CGGCG	2	10	13688	13697	0 %	0 %	60 %	40 %	378975707
260	NC_016838	TCT	2	6	13830	13835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975707
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263	NC_016838	TAA	2	6	13977	13982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975707
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372	NC_016838	TTGT	2	8	20056	20063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
373	NC_016838	GAT	2	6	20225	20230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
374	NC_016838	ATT	2	6	20242	20247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_016838	AGC	2	6	21788	21793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975714
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